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Catalogue de nos produits et services

- Kits d'échantillonnage ADNe -

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Constitué de :

A associer à une pompe à membrane longue durée (pour des milieux courants) ou à une seringue (milieux stagnants).

Kit aquatique

Pour vos prélèvements marins ou d'eau douce, choisissez nos kits pour échantillonner de grands volumes d'eau de manière simple et pratique.

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1 kit = 1 échantillon

40€ HT

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Constitué de :

  • Flacon hermétique 250mL contenant des gels de silice

  • Sachet Whirl-Pak 2L

  • Paire de gants

  • Protocole d'échantillonnage

Kit terrestre

Echantillonnez vos sols et fèces grâce à nos kits adaptés pour la collecte et la conservation d'ADN terrestre.

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1 kit = 1 échantillon
8€ HT

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Constitué de :

  • Flacon hermétique 250mL contenant des gels de silice

  • Sachet Whirl-Pak 2L

  • Seringue 60mL

  • Paire de gants

  • Protocole d'échantillonnage

Kit sédiments

Collectez vos échantillons de sédiments de manière fiable et standardisée !

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1 kit = 1 échantillon
11€ HT

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Constitué de :

  • Tube 2mL contenant tampon de préservation de l'ADN

  • Ecouvillon (ou swab)

  • Paire de gants

  • Protocole d'échantillonnage

Kit écouvillon

Analyse de régime alimentaire, détection d'espèces à enjeux... faites-parler vos échantillons environnementaux via un simple frottement swab !

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1 kit = 1 échantillon

4€ HT

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Constitué de :

  • Capteur passif (fibre de verre, lingette...)

  • Tube contenant tampon de préservation de l'ADN

  • Paire de gants

  • Protocole d'échantillonnage

Kit capteurs passifs

Installez des capteurs passifs d'ADNe afin de collecter des informations taxonomiques sur une longue durée.

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1 kit = 1 échantillon

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Capteurs passifs CAPA_edited.jpg

- Matériel d'échantillonnage aquatique -

Conçues pour la capture d'ADNe et la filtration de grands volumes d'eau en milieu aquatique.

18€ HT / unité

 

Filtre en polyéthersulfone - jusqu'à 100L d'eau filtrée - à associer à une pompe

Capsules de filtration Waterra

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  • Surface du filtre : 300cm² ou 600cm²

  • Diamètres de pores disponibles :

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Tampon Longmire

Constitué d'agents de stabilisation de l'ADN, ce tampon permet d'assurer une conservation optimale de vos échantillons aquatiques jusqu'à leur traitement au laboratoire.

22€ HT / unité

Composition : H2O ; Tris-HCl ; EDTA ; NaCl ; adapté de Longmire et al. (1997)

Volume : 50mL / capsule

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Pompe de filtration

Une pompe certifiée CE, sur batterie longue durée et rechargeable, dans une valise étanche pour réaliser vos filtrations aquatiques.

Achat : 950€ HT

Location : 100€ HT / journée d'utilisation

Durée de fonctionnement sur batterie : 12h

Durée de recharge de la batterie : 4h

Contrôle du volume filtré en temps réel grâce au débitmètre

Voltmètre

Filtration en amont : il n'est pas nécessaire de changer les tuyaux entre 2 prélèvements

Volume filtré : une trentaine de minutes pour 30L d'eau peu turbide

A associer à un kit tuyaux (tuyaux d'entrée et de sortie de pompe)

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Shaker

Achat : 700€ HT

Location : 100€ HT seul ou 180€ HT avec une pompe / journée d'utilisation

Durée de fonctionnement sur batterie : 2h

Durée de recharge de la batterie : 1h

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Portable et sur batterie, le shaker est conçu pour agiter le tampon Longmire à l'intérieur de la capsule et favorise la resuspension de l'ADN.

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Quad-holder

Achat : 400€ HT

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Réalisez simultanément jusqu'à 4 prélèvements aquatiques grâce à cet adaptateur permettant d'optimiser le temps d'échantillonnage.

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4 capsules nécessitent 4 pompes

Perche télescopique

Achat : 100€ HT

Facilitez votre échantillonnage aquatique en associant les capsules et/ou le quad-holder à une perche.

Perche télescopique

- Formations ADNe -

En visioconférence (gratuit) ou sur le terrain

Discussion autour de votre problématique et de la stratégie d'échantillonnage 

Utilisation du matériel, bonnes pratiques, minimisation des contaminations... une formation personnalisée en amont de vos prélèvements aquatiques et terrestres !

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Formation échantillonnage

En visioconférence ou dans nos locaux

Formation ADNe

Phase laboratoire, pipeline bioinformatique, résultats attendus... nous vous expliquons tous les éléments derrière une analyse ADNe.

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En visioconférence ou dans nos locaux

  • Formation individuelle : 1200€/jour

  • Formation collective (minimum 3 stagiaires) : 400€/jour

Formation bioinformatique

Apprenez à analyser un jeu de données de séquençage NGS pour obtenir la liste des MOTUs et des taxons.

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- Analyses ADNe -

  • Matrices de départ : filtration d'eau, sol, sédiments, contenus stomacaux, fèces, écouvillons, miel, pollen, mouches, fleurs, etc.

  • Des protocoles conçus pour éviter toute contamination

Extraction d'ADN

Nous réalisons vos extractions d'ADN intra et extracellulaire dans un laboratoire dédié à la manipulation d'échantillons environnementaux.

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  • Matrices de départ : extraits ADN, eau, sol, sédiments, contenus stomacaux, fèces, écouvillons, miel, pollen, mouches, fleurs, etc. 

  • Groupes taxonomiques ciblés : bactéries, animaux, plantes, insectes, poissons, mammifères, etc.

  • Une méthodologie transparente et des résultats fiables

Inventaire metabarcoding

A partir de vos prélèvements environnementaux, nous dressons des inventaires de biodiversité aquatique et terrestre.

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  • Matrices de départ : extraits ADN, eau, sol, sédiments, contenus stomacaux, fèces, swabs, miel, pollen, mouches, fleurs, etc.

  • Espèces détectées : requins, raies, crapauds, tritons, silures, vipères, algues...

  • Méthodologie qPCR transparente et résultats fiables

Détection d'espèces

Traquez de manière non invasive vos espèces d'intérêt (menacées, envahissantes, etc.). 

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  • Pipeline bioinformatique développé pour des données metabarcoding ADNe

  • Livrables clairs et vulgarisés

  • Méthodologies transparentes

Analyse bioinformatique

Confiez-nous l'analyse de vos données de séquençage NGS pour obtenir la liste des taxons identifiés.

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  • Analyses statistiques robustes

  • Indices de diversité

  • Livrables clairs et vulgarisés

Analyse écologique

Grâce à des analyses statistiques et des données de terrain, nous faisons parler vos données ADNe pour obtenir des informations écologiques.

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- Développement -

Marqueur metabarcoding

Vous souhaitez inventorier un groupe taxonomique dont les amorces ne sont pas encore connues ? Nous développons un marqueur adapté à votre projet.

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  • Design de novo in silico & test in vitro / in situ

  • Optimisation à partir d'amorces publiées & test in vitro / in situ

  • Design d'amorces de novo in silico & test in vitro sur vos échantillons de tissus

  • Optimisation à partir d'amorces publiées & test in vitro / in situ

Marqueur qPCR

Vous souhaitez détecter une espèce dont les amorces ne sont pas encore connues ? Nous développons un marqueur spécifique adapté à votre problématique.

  • Design amorces et sonde de novo in silico & test in vitro sur vos échantillons de tissus

  • Optimisation à partir d'amorces et sonde publiées & test in vitro / in situ

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Amorce de blocage

Afin de bloquer l'amplification d'une espèce non-cible, nous développons une amorce spécifique de blocage.

  • Design d'amorce & test in vitro 

  • Exemple : éviter d'amplifier l'espèce hôte pour une analyse de régime alimentaire

Base de référence

Nous établissons votre base de référence à partir d'échantillons de tissus afin d'optimiser la résolution de vos futurs inventaires ADNe.

  • Design de novo in silico & test in vitro / in situ

  • Optimisation à partir d'amorces publiées & test in vitro / in situ

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