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Capsules de filtration ADNe
Grâce à un partenariat privilégié avec la société canadienne Waterra qui commercialise des équipements d'échantillonnage et de surveillance aquatique, ARGALY est devenu revendeur exclusif en Europe de leurs capsules de filtration eDNA. Ces capsules sont très efficaces pour récupérer l'ADN des organismes aquatiques à partir de filtrations de larges volumes d'eau (courante ou stagnante).
Les caracteristiques des capsules
Les capsules commercialisées possèdent un filtre de polyethersulphone d'une surface de 600 centimètres carrés et avec un diamètre de pores de 0,45 microns, permettant de récupérer l'ADN des organismes aquatiques.
Ces filtres peuvent être utilisés dans des eaux à forte turbidité et les volumes d'eau filtrés peuvent aller jusqu'à 100 litres.
D'autres tailles de pore sont disponibles sur demande: 0.1, 0.2, 0.45, 1 et 5 microns.
La pompe de filtration
La pompe (certifiée CE) est connectée à une batterie qui tient la charge jusqu'à 12h avec seulement 4h de rechargement. Un débitmètre présent en sortie de pompe permettant de connaitre le volume filtré à tout moment.
Le tout est inclus dans une valise étanche, équipée d'une bandoulière, ce qui vous permet de faire vos prélèvements avec les mains libres et les pieds dans l'eau, si nécessaire.
La technique de filtration
La technique de filtration proposée par ARGALY, avec une filtration en amont du système de pompage, permet de ne pas avoir à changer tous les tuyaux à chaque prélèvement et de limiter les risques de contamination.
Ainsi, une extrémité du tuyau est placée en sortie de capsule et l'autre extrémité est reliée à une pompe à membrane. Un deuxième tuyau en sortie de pompe permet alors d'évacuer l'eau filtrée. A titre d'exemple, une filtration de 30 minutes dans une eau claire permet de collecter environ 40 litres d'eau.
Une fois la filtration terminée, la capsule est vidée de toute eau résiduelle puis remplie d'un tampon de préservation de l'ADN. Des bouchons étanches permettent de sceller la capsule. Après agitation énergique de la capsule, le tampon de conservation sera soit récupéré dans un tube Falcon, soit préservé dans la capsule à température ambiante jusqu’à son envoi au laboratoire.
Le shaker
Pour récolter un maximum d'ADN, nous vous recommandons une agitation très vive directement sur le terrain après avoir mis le tampon de conservation dans la capsule.
En effet, des tests ont montré que l'ADN se décroche plus facilement s'il est immédiatement remis en suspension, et moins bien s'il reste quelques jours/semaines accroché à la membrane avant agitation au laboratoire.
Notre fournisseur Waterra a développé un shaker, adapté à ses capsules, et très facile d'utilisation, pour vous aider à optimiser la quantité d'ADN collecté lors de vos prélèvements aquatiques.
Les references
Ces capsules de filtration ont été comparées à d'autres méthodes de détection d'espèces aquatiques et leur efficacité a été démontrée (voir l'article scientifique à ce sujet : Peixoto et al. 2020).
D'autre part, des chercheurs du Laboratoire d'Ecologie Alpine de Grenoble (Dr Pierre Taberlet and Dr Frédéric Boyer) ont validé de façon approfondie ces capsules dans le cadre de leurs projets de recherche.
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