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Capsules de filtration ADNe
Capsules
Grâce à un partenariat privilégié avec la société canadienne Waterra qui commercialise des équipements d'échantillonnage et de surveillance aquatique, ARGALY est devenu revendeur exclusif en Europe de leurs capsules de filtration eDNA. Ces capsules permettent de récupérer l'ADN des organismes aquatiques à partir de filtrations de larges volumes d'eau (courante ou stagnante).
Les capsules commercialisées possèdent un filtre de polyéthersulfone d'une surface de 600 centimètres carrés et d'un diamètre de pores de 0.45 microns, permettant de récupérer l'ADN des organismes aquatiques.
Ces filtres peuvent être utilisés dans des eaux à forte turbidité et les volumes d'eau filtrés peuvent aller jusqu'à 100 litres.
D'autres tailles de pore sont disponibles sur demande :
0.1, 0.2, 0.45, 1.2 et 5 microns.
Pompe de filtration
Pompe
La pompe (certifiée CE) est connectée à une batterie qui tient la charge jusqu'à 12h avec seulement 4h de rechargement. Un débitmètre présent en sortie de pompe permettant de connaitre le volume filtré à tout moment.
Le tout est inclus dans une valise étanche, équipée d'une bandoulière, ce qui vous permet de faire vos prélèvements avec les mains libres et les pieds dans l'eau, si nécessaire.
Technique de filtration
Technique
La technique de filtration proposée par ARGALY s'effectue en amont du système de pompage, ce qui présente l'avantage de ne pas avoir à changer tous les tuyaux à chaque prélèvement et de limiter les risques de contamination.
Ainsi, une extrémité du tuyau est placée en sortie de capsule et l'autre extrémité est reliée à une pompe à membrane. Un deuxième tuyau en sortie de pompe permet alors d'évacuer l'eau filtrée. A titre d'exemple, une filtration de 30 minutes dans une eau claire permet de collecter environ 40 litres d'eau.
Une fois la filtration terminée, la capsule est vidée de toute eau résiduelle puis remplie d'un tampon de préservation de l'ADN. Des bouchons étanches permettent de sceller la capsule. Après agitation énergique de la capsule, le tampon de conservation sera soit récupéré dans un tube Falcon, soit préservé dans la capsule à température ambiante jusqu’à son envoi au laboratoire.
Shaker
Shaker
Pour récolter un maximum d'ADN, nous recommandons une agitation très vive directement sur le terrain après avoir mis le tampon de conservation dans la capsule.
En effet, des tests ont montré que l'ADN se décroche plus facilement de la membrane de la capsule s'il est immédiatement remis en suspension, et moins bien s'il reste quelques jours/semaines accroché à la membrane avant agitation au laboratoire.
Notre fournisseur Waterra a développé un shaker, adapté à ses capsules, et très facile d'utilisation, pour vous aider à optimiser la quantité d'ADN collecté lors de vos prélèvements aquatiques.
Ces capsules de filtration ont été comparées à d'autres méthodes de détection d'espèces aquatiques et leur efficacité a été démontrée :
- Peixoto et al. 2020
- Douchet et al. 2021
- Souissi et al. 2022
- Nikolic et al. 2023
- Roblet et al. 2024
D'autre part, des chercheurs du Laboratoire d'Ecologie Alpine de Grenoble (Dr Pierre Taberlet & Dr Frédéric Boyer) ont validé de façon approfondie ces capsules dans le cadre de leurs projets de recherche.
Pour en savoir plus, n'hésitez pas à nous contacter !
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