Notre offre
Analyses ADNe
& bioinformatique
Nous proposons des analyses de biodiversité
à partir de sol, de sédiment, d'eau et autres matrices et des analyses de
régimes alimentaires
à partir de fèces ou contenus stomacaux.
Nous établissons également vos
bases de références.
Nous concevons vos amorces (metabarcoding ou qPCR) à façon
et réalisons vos
analyses bioinformatiques (metabarcoding Illumina) et analyses statistiques.
Nous proposons d'effectuer
l'échantillonnage ADNe
sur le terrain de façon fiable et standardisée ou de vous former à le faire.
Nous vous proposons des kits de prélevements terrestres ou aquatiques.
Nous pouvons également
effectuer
l'extraction ADNe
directement
sur le terrain !
Pour les étudiants et chercheurs en écologie et environnement :
-
Un cours magistral sur l'ADNe (potentiel, limites et avantages)
-
Un TP avec un cas d'étude et échantillonnage sur le terrain
-
Un TD avec analyse bioinformatique et interprétation des résultats
Enseignement
Expéditions terrain
metabarcoding
eDNA
soil sampling
diet analysis
Options d'analyses
Groupes taxonomiques
étudiés
-
Eucaryotes
-
Mammifères
-
Insectes
-
Plantes
-
Poissons
-
Acariens
-
Chiroptères
-
Champignons
-
Oiseaux
-
Bactéries
-
Autres: nous contacter
Echantillonnage
-
En autonomie :
Vous réalisez le prélèvement après avoir suivi une formation gratuite proposée par ARGALY, ou en suivant un protocole que nous vous fournissons.
-
Par ARGALY :
Nous gérons l'intégralité de l'échantillonnage (stratégie, expédition, prélèvement)
Types d'échantillons collectés
-
Sol
-
Eau
-
Fèces
-
Sédiments
-
Contenus stomacaux
-
Mouches à sang
-
Pollen
-
Autres : nous contacter
Notre methodologie de travail
1.Phase Initiale
-
Discussion autour du projet
-
Conception des expérimentations
Etude pilote optionnelle
3.Phase Laboratoire
-
Extraction ADNe
-
Amplification ADNe
-
Séquençage haut-débit
2.Phase Terrain
-
Envoi de kits d'échantillonnage (optionnel)
-
Échantillonnage terrain
4.Résultats
-
Analyses bioinformatiques
-
Analyses écologiques (optionnel)
-
Rapport d'analyses
-
Discussions autour des résultats
