Notre offre

Analyses ADNe
& bioinformatique
Nous proposons des analyses de biodiversité
à partir de sol, de sédiment, d'eau et autres matrices et des analyses de
régimes alimentaires
à partir de fèces ou contenus stomacaux.
Nous établissons également vos
bases de références.
Nous concevons vos amorces (metabarcoding ou qPCR) à façon
et réalisons vos
analyses bioinformatiques (metabarcoding Illumina) et analyses statistiques.



Nous proposons d'effectuer
l'échantillonnage ADNe
sur le terrain de façon fiable et standardisée ou de vous former à le faire.
Nous vous proposons des kits de prélevements terrestres ou aquatiques.
Nous pouvons également
effectuer
l'extraction ADNe
directement
sur le terrain !

Pour les étudiants et chercheurs en écologie et environnement :
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Un cours magistral sur l'ADNe (potentiel, limites et avantages)
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Un TP avec un cas d'étude et échantillonnage sur le terrain
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Un TD avec analyse bioinformatique et interprétation des résultats
Enseignement
Expéditions terrain
metabarcoding
eDNA
soil sampling
diet analysis

Options d'analyses
Groupes taxonomiques
étudiés



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Eucaryotes
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Mammifères
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Insectes
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Plantes
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Poissons
-
Acariens
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Chiroptères
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Champignons
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Oiseaux
-
Bactéries
-
Autres: nous contacter
Echantillonnage


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En autonomie :
Vous réalisez le prélèvement après avoir suivi une formation gratuite proposée par ARGALY, ou en suivant un protocole que nous vous fournissons.
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Par ARGALY :
Nous gérons l'intégralité de l'échantillonnage (stratégie, expédition, prélèvement)
Types d'échantillons collectés


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Sol
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Eau
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Fèces
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Sédiments
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Contenus stomacaux
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Mouches à sang
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Pollen
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Autres : nous contacter

Notre methodologie de travail
1.Phase Initiale

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Discussion autour du projet
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Conception des expérimentations
Etude pilote optionnelle
3.Phase Laboratoire

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Extraction ADNe
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Amplification ADNe
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Séquençage haut-débit
2.Phase Terrain

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Envoi de kits d'échantillonnage (optionnel)
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Échantillonnage terrain
4.Résultats

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Analyses bioinformatiques
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Analyses écologiques (optionnel)
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Rapport d'analyses
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Discussions autour des résultats